אומרים כלבים הם חיות חמודות או כלבים הן חיות חמודות?

הם כי הכוונה לכלבים

הם, הכוונה היא לכלבים לכן זה בלשון זכר.

כלבים הם זכרים, ככה ש"כלבים הם (מתייחס לכלבים, לא לחיות) חיות חמודות (מתייחס לחיות)"

הם, מתייחסים לכלבים

הם