כל האטומים בעלי אותו מספר נויטרונים שייכים לאותו יסוד?

אם מספר הניוטרונים ופרוטונים שווה זה אותו יסוד

לא.
הפרוטונים הם אלה שמייחדים את חומר האטום.
יכולים להיות אטומים של אותו החומר עם אייזוטופים המכילים מספר ניוטרונים שונים.
כמו li6 ו-li7(גרסה של ליתיום עם 3 ניוטרונים וגרסה עם 4).

מספר האלקטרונים גם יכול להשתנות. כל עוד מספר הפרוטונים נשאר אותו הדבר אז זה אותו החומר. מספר אלקטרונים וניוטרונים שונה משפיע על דברים אחרים, כמו: יציבות האטום, המולקולות שהוא יהיה חלק מהן וסוגי הקשרים שהוא יצור, המטען שלו, המשיכה האלקטרונגטיבית שלו...