מהירות בפיזיקה יכולה להיות שלילית?

בתור וקטור, כן. במקרה זה כיוון המהירות מנוגד לכיוון החיובי של ציר המקום שנבחר.
בתור גודל, לא. גודל הוא מספר חיובי תמיד.