שלום יש לי שאלה בהלכה

לפעמים כשאני לומד תורה אני מסמן דברים או כותב הערות ע"ג הספר עצמו. האם זה אסור? כי אולי זה מחלל את הספר? וגם האם מותר לי לסמן ככה קטעים מסוימים בשבת? לא לכתוב לדוגמא לסמן בקו או משהו. תודה