זה הגיוני שבפלייסטיישן שלי יש 500gb אבל זה מראה בהגדרות שיש לי רק 408.5 gb?

כן.
כשאומרים שיש לקונסולה שלך 500gb, זה כולל המקום שתופסת מערכת ההפעלה.
בפועל יהיה לך פחות מקום לאחסן דברים, כמו משחקים, סרטונים או תמונות

כן המערכת תופסת מקום ונשאר פחות

כן, זה כמו שדיסק און קי של 56 gb אין באמת 56 יש 50 בערך או בטלפון שרשום שיש לך 128gb יש לך בעצם פחות כי המערכת גם תופסת מקום