98.9% מן הפחמן בטבע הוא איזוטופ הפחמן C 12. שני איזוטופים נוספים של פחמן C 13, C 14 מהווים אחוז מזערי מן הפחמן בטבע. ארכיאולוגים משתמשים באיזוטופ C 14 לקביעת גילם של ממצאים שמקורם מן החי או מן הצומח. לאיזוטופים של הפחמן יש: 1.מספר זהה של פרוטונים 2.מסה זהה 3.גרעינים זהים 4.נויטרון אחד יותר מאשר פרוטונים